Los ahora dirigidos por Hernán Cristante conquistaron tres títulos consecutivos y dio la vuelta olímpica en la capital del Estado de México. En el Verano 1998 se impuso a Necaxa; en el Verano 1999, en tandas de tiro penal, le ganó al Atlas ; mientras que en el Verano 2000 vapuleó en el global a Santos Laguna 7-1 .
El primer revés de los choriceros tras recibir la vuelta en casa fue ante Monarcas Morelia en el Invierno 2000; cobró venganza en el Apertura 2002 contra los purépechas; perdió con Chivas en el Apertura 2006; además de imponerse a Cruz Azul (Apertura 2008) y nuevamente a Santos (Bicentenario 2010).
Perdió la última final que jugó y que recibió la vuelta en casa: ante los Xolos de Tijuana en el Apertura 2012.
Toluca definirá la final ante Santos en el Nemesio Díez donde tiene saldo positivo pero tampoco ha sido invencible.
Si Santos Laguna salta a la cancha del Nemesio Díez con exceso de confianza, su historia podría hacerle pasar un mal rato. Pese a que ganaron 2-1 la final de ida del Clausura 2018, contra el Toluca, sus números advierten que la vuelta será más que complicada.
De 10 finales de Liga que Santos ha disputado, en cuatro ocasiones logró la victoria en el duelo de ida, pero cerró airoso la llave sólo en dos.
En los torneos 1993-94 y Apertura 2010, los de la Comarca pegaron primero y como locales ante Tecos (1-0) y Monterrey (3-2), respectivamente, sin embargo, estos rivales le dieron la vuelta al marcador en el enfrentamiento de vuelta.
En los torneos donde los laguneros se impusieron desde la ida, fueron en el Clausura 2008 (Cruz Azul 1-2) y Clausura 2015 (Querétaro (5-0). Contra los Cementeros, Santos resistió al empate 1-1 para hacerse del título con global 3-2. Mientras que la vuelta contra los Gallos Blancos de Ronaldinho, los Guerreros pecaron de exceso de confianza al permitir tres anotaciones del rival, aunque salvaron el marcador por 5-3.