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Juan Ramón de la Fuente nació en la Ciudad de México en 1951. Estudió Medicina en la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) y Psiquiatría en la Clínica Mayo de Rochester, Minnesota.
Ha publicado más de 200 trabajos y editado 20 libros sobre investigación, medicina y educación; por sus aportaciones científicas recibió el Premio Nacional de Ciencias y Artes en 2006.
Fue secretario de Salud del gobierno federal de 1994 a 1999 y rector de la UNAM de 1999 a 2007. Ha sido presidente de las academias Mexicana de Ciencias y Nacional de Medicina.
Es doctor honoris causa por diversas universidades: Montreal, Alcalá de Henares, Moscú, Nacional de Colombia, La Habana, Santo Domingo y la UNAM, entre otras. Es profesor titular en la Facultad de Medicina de la UNAM, donde dirige el Seminario de Estudios sobre la Globalidad y preside el Consejo del Aspen Institute en México.
En diciembre de 2017, el Consejo Universitario de la Universidad Nacional aprobó su designación como profesor emérito de la Facultad de Medicina.
En su designación como profesor emérito, los consejeros universitarios destacaron su trabajo como investigador en lo relacionado al alcoholismo, el cual permitió la construcción de un instrumento universalmente válido para la identificación de este problema, el cual fue adoptado por la Organización Mundial de la Salud (OMS) y la Organización Internacional del Trabajo (OIT).
Destacó por su labor como secretario de Salud, cuando logró el ingreso al país de los medicamentos genéricos.